修正本辦法部分條文，其修正要點如下(詳如附件檔案總說明)：
(一)增訂教師育嬰留職停薪，而任職累計已達六個月，辦理另予成績考核；考核年度內全無工作事  實者，或配合現行教師法規定，修正經依法解聘、不續聘，不再辦理年終成績考核或另予成績考核；增訂教師留職停薪借調公立學校教師之考核方式。(修正條文第三條)
(二)增訂考核年度內對學生有體罰、霸凌之情形者，不得考列第四條第一項第一款；及增訂有性騷擾、性霸凌行為，或違反校園性侵害性騷擾或性霸凌防治準則第六條、第七條或第八條規定 ，不得考列第四條第一項第一款。（修正條文第五條）
(三)配合教師法及防制準則規定，修正教師平時考核之記大過、記過及申誡規定明定教師隱匿或延遲通報學生涉犯毒品事件，或要求藥物濫用個案學生辦理休、轉學等情形，予以記大過、記過；並增訂懲處因訴願、行政訴訟或其他救濟程序經撤銷而須另為懲處者，其懲處權之行使期間起算時點 。（修正條文第六條）
(四)增訂考核會主席因故不能主持會議時之運作；明定選舉與被選舉資格規定。（修正條文第九條）
(五)增訂考核會委員迴避之人數計算。（修正條文第十條）
(六)修正先行發布之獎勵令提交考核會確認之時限，並增訂救濟規定 。 （修正條文第十四條）
(七)避免主管機關過度干預學校之考核結果，落實適法性之監督意旨，修正文字 。 （修正條文第十五條)
(八)明定考核會執行委員職務之課務安排。（修正條文第十九條）
(九)修正教師留職停薪借調至公立學校教師之考核方式；配合現行教師法配合現行教師法有關終局停聘及暫時停聘之規定，修正停聘教師經復聘得有關終局停聘及暫時停聘之規定，修正停聘教師經復聘得辦理辦理另予成績考核考核之文字。（修正條文第二十一條）。