依據衛生福利部疾病管制署（以下稱疾管署）監測資料顯示， 105 年及 108 年腸病毒 A71 型雖再度活躍，但其感染人數及重症疫情規模相較過去歷次大流行緩和，然社區仍持續檢出腸病毒 A71 型，無法完全排除本年仍有引發流行疫情之可能性。另由於新生兒免疫力尚未發展完全，感染腸病毒後併發重症及死亡的機率較高，加上克沙奇 B 型病毒及伊科病毒都曾造成國內新生兒腸病毒重症疫情，目前尚無法推估其流行頻率，故仍須防範新生兒腸病毒群聚與重症疫情之發生。此外，腸病毒 D68 型曾於 106 年造成 12 例重症個案，如依國際經驗，其流行週期約為 2 年，而 107 與 108 年間僅有零星重症個案發生，不排除 109 年再度活躍之可能性。